La Colmena es un bloque utilitario que alberga abejas y permite a los jugadores recolectar Botellas de Miel y Panales. Funciona idénticamente a un Nido de Abejas, pero es fabricado por los jugadores. Una Colmena se fabrica usando 6 Tablas de cualquier tipo y 3 Panales en una cuadrícula de fabricación de 3×3. Una Colmena puede contener hasta tres abejas, que entran y salen para recolectar polen de flores. Cuando una Colmena alcanza el nivel de miel 5, los jugadores pueden usar Botellas de Vidrio para recolectar Botellas de Miel o Tijeras para recolectar Panales. Usar Tijeras o Botellas de Vidrio sin una Fogata o Fuente de Humo debajo enojará a las abejas, causando que ataquen.

Una Colmena se puede extraer con cualquier herramienta, pero los hachas la rompen más rápido. A diferencia de un Nido de Abejas, una Colmena no se genera naturalmente y debe fabricarse, lo que la hace útil para crear granjas de abejas artificiales.