Mehiläispesä on hyötyesine, joka asuttaa mehiläisiä ja mahdollistaa Hunajapullojen ja Hunajakekojen keräämisen. Se toimii identtisesti Mehiläispesän kanssa, mutta on pelaajien valmistama. Mehiläispesä valmistetaan käyttämällä 6 Lankkulohkoa mistä tahansa tyypistä ja 3 Hunajakekkoa 3×3 valmistusruudukossa. Mehiläispesä voi sisältää enintään kolme mehiläistä, jotka tulevat ja menevät kerätäkseen siitepölyä kukilta. Kun Mehiläispesä saavuttaa hunajatason 5, pelaajat voivat käyttää Lasipulloja kerätäkseen Hunajapulloja tai Saksia kerätäkseen Hunajakekkoja. Saksien tai Lasipullojen käyttäminen ilman Nuotiota tai Savulähdettä alapuolella suututtaa mehiläiset, jotka hyökkäävät.

Mehiläispesän voi louhia millä tahansa työkalulla, mutta kirves on nopein. Toisin kuin Mehiläispesä, Mehiläispesää ei synny luonnollisesti ja se täytyy valmistaa, mikä tekee siitä hyödyllisen keinotekoisten mehiläisviljelyjen luomiseen.