Czaszka mrocznego szkieletu jest uzyskiwany przez zabicie szkieletów Withera, które pojawiają się w fortecach Netheru. Ma 2,5% szansy upuszczenia, którą można zwiększyć za pomocą zaklęcia Łupiestwo, nawet do 5,5% przy Łupiestwo III.

Czaszka mrocznego szkieletu jest głównie używany do przywołania bossa Withera, wymagając trzech czaszek umieszczonych na duszy piasku lub duszy gleby. Można go również nosić jako hełm do dekoracji i umieścić na bloku dźwiękowym, aby po aktywacji wydawał dźwięk szkieletu Withera.