Střední ametystový pupen je druhým stupněm růstu ametystového klastru, který se přirozeně tvoří na rodícím ametystovém bloku v ametystových geódách. Postupem času doroste do stádia velkého ametystového pupenu a nakonec do finálního stádia ametystového klastru, který při těžbě upouští ametystové úlomky.
Střední ametystový pupen vyzařuje světlo o intenzitě 2 a lze jej dekorativně umístit na pevné bloky s plným povrchem. Při interakci nebo zásahu projektily vydává charakteristický křišťálový zvuk.