Bikuben er en bruksblokk som huser bier og lar spillere høste Honningflasker og Honningkaker. Den fungerer identisk med en Bikube, men lages av spillere. En bikube lages ved å bruke 6 Planker av hvilken som helst type og 3 Honningkaker i en 3×3 håndverksrute. En bikube kan romme opptil tre bier, som går inn og ut for å samle pollen fra blomster. Når en bikube når honningnivå 5, kan spillere bruke glasflasker til å samle Honningflasker eller saks til å samle Honningkaker. Bruk av saks eller glasflasker uten en Leirbål eller røykilde under vil gjøre biene sinte og få dem til å angripe.
En bikube kan brytes med hvilket som helst verktøy, men økser bryter den raskest. I motsetning til en Bikube genereres ikke en bikube naturlig og må lages, noe som gjør den nyttig for å lage kunstige bifarmer.