Mağara
Mağara, bazen cavern olarak da anılır, Overworld ve Nether boyunca doğal olarak oluşan içi boş alanlardır. Bu yeraltı boşlukları hava, su veya lavayla dolu olup duvarlarında sıklıkla çevre taşı, derin şist ve değerli maden yataklarını açığa çıkarır. Bir Mağaranın içindeki ışık seviyeleri genellikle çok düşük olduğundan, zombiler, iskeletler ve örümcekler gibi düşman moblar içlerinde serbestçe spawnlanma eğilimindedir. Yarasalar ve parlak mürekkep balıkları da yaygın sakinlerdir.
Bir Mağara için iki geniş oluşum kategorisi bulunmaktadır: gürültü mağaraları ve oyma mağaralar. Gürültü mağaraları, temel arazi oluşumunun bir parçası olarak Perlin gürültüsü algoritmaları tarafından şekillendirilir ve üç biçimde görünür — büyük açık odalar olan peynir mağaraları; uzun kıvrımlı geçitler oluşturan spagetti mağaraları; ve daha dar ve düzensiz olan erişte mağaraları. Gürültü mağaraları, speleotem benzeri sütunlar ve derinliklerine bağlı olarak su veya lava barındıran akiferler olarak bilinen yeraltı sıvı kütleleri de içerebilir.
Oyma mağaralar, temel arazinin üstüne katmanlı ayrı özellikler olarak oluşturulur. Dal geçitlü kıvrımlı tünel ağları, elipsoid odalar veya daha basit I ve T şekilli düzenlemeler biçimini alabilirler. Oyma bir Mağara, yüzeye kadar kırılabilir, maden şaftlarıyla veya canavar odalarıyla kesişebilir ve Overworld'de Y=−56 ile Y=180 arasında, Nether'de ise Y=0 ile Y=126 arasında görünür.
Overworld'de birkaç farklı Mağara biyomu mevcuttur. Sarkıt mağaralar sivri sarkıt oluşumlarına ve blok sütunlarına sahiptir. Gür mağaralar; mağara asmaları, azalea bitkileri, kil havuzları içerir ve semenderlerin üreme alanı olarak hizmet eder. Derin karanlık; sculk blokları ve bekçilerin gözetimindeki antik şehirleri barındıran özellikle tehlikeli bir derin şist biyomudur. Su altı oyma mağaralar, okyanus tabanlarının altında bulunan tamamen sular altında kalmış varyanttır.