Grotte
Grotter, som noen ganger omtales som kaverler, er naturlig forekommende hule rom som dannes gjennom hele Overworld og Nether. Disse underjordiske tomrommene er fylt med luft, vann eller lava og eksponerer ofte omkringliggende stein, dypskifer og verdifulle malmforekomster i veggene sine. Siden lysnivåene inne i en Grotte vanligvis er svært lave, har fiendtlige mobs som zombier, skjeletter og edderkopper en tendens til å spawne fritt inne i dem. Flaggermus og lysende blekkspruter er også vanlige beboere.
Det finnes to brede genereringskategorier for en Grotte: støygrotter og uthulte grotter. Støygrotter formes av Perlin-støyalgoritmer som del av basisterrenget og vises i tre former — ostefrotter, som er store åpne kamre; spaghetti-grotter, som danner lange snirklete passasjer; og nudel-grotter, som er smalere og mer uregelmessige. Støygrotter kan også inneholde stalaktittlignende søyler og underjordiske væskekropper kjent som akviferer, som inneholder vann eller lava avhengig av dybden.
Uthulte grotter genereres som separate trekk lagvis på toppen av basisterrenget. De kan ha form av snirklete tunnelnettverk med forgrenede passasjer, ellipsoide kamre eller enklere I- og T-formede oppsett. En uthult Grotte kan bryte gjennom til overflaten, krysse gruvesjakter eller monster-rom, og dukker opp i Overworld mellom Y=−56 og Y=180, samt i Nether mellom Y=0 og Y=126.
Flere distinkte Grotte-biomer eksisterer i Overworld. Drypstensgrotter har spisse drypstensformasjoner og blokksøyler. Frodige grotter inneholder grottevinranker, azaleaplanter, leiredammer og fungerer som gyteplasser for axolotler. Det dype mørket er et særlig farlig dypskifer-biom som huser sculk-blokker og gamle byer overvåket av vakter. Undervannshulte grotter er fullt oversvømmede varianter funnet under havbunner.