
深海是主世界中最大、最深的水生环境之一,与标准海洋的区别在于海底位置更低——通常约在Y=30处。这种可观的深度源于世界生成时极低的大陆性值,将深海远远推离陆地。它处于中等温度带,暖侧毗邻温水深海,冷侧毗邻深层寒冷之洋。唯一能与其直接相邻的陆地生物群系是蘑菇岛。
深海的海床主要由砾石构成,遍布密集的海带和高大海草,浓度明显高于较浅的海洋变种。地形中散落着沉船和海底废墟,为愿意潜入黑暗的探险者提供战利品。最值得注意的是,海底神殿仅在深海中生成,使其成为游戏中守卫者和远古守卫者的唯一栖息地。
海底神殿的存在使深海成为Minecraft中最危险的水下生物群系之一。远古守卫者会对附近玩家施加挖掘疲劳状态效果,对任何试图掠夺该建筑的人造成持续阻碍。神殿之外,水域中栖息着鳕鱼、鲑鱼、海豚、鱿鱼和鹦鹉螺,而溺尸则在海底较暗处游荡,为长时间潜水增添了额外危险。