海底神殿

海底神殿（海底遺址）是一種龐大而罕見的水下結構，僅會在深海生態域及其變體中生成。它是遊戲中海綿唯一的自然來源，也是僅有的兩種可自然找到海磷石的結構之一，另一種則是海底廢墟。與許多其他生成結構不同，海底神殿內部任何地方都沒有戰利品箱。想要尋找它的玩家，可以向老手等級的製圖師村民交易取得海洋探險家地圖，該地圖會標示出最近的海底神殿位置。

整座海底神殿由海磷石、海磷石磚、暗海磷石與海燈籠建造而成，數根巨大的柱子自結構向下延伸至海底。內部的中央區域有一系列隨機排列的房間，並連接至兩側的側翼；核心處則矗立著一間高大的寶藏室，內有八個以暗海磷石包覆的金方塊。部分海底神殿還設有海綿室，每間的天花板上都嵌有濕海綿，不過並非每座海底神殿都保證會出現這種房間。

結構內固定棲息著三隻遠古深海守衛：一隻位於中央區域頂端，兩側翼各有一隻。這些強大的生物會對附近的玩家施加挖掘疲勞 III，大幅拖慢玩家破壞神殿牆壁的速度。周圍區域同時也是一般深海守衛唯一的自然生成地點，牠們會在此持續不斷地出現。在世界中任何 512×512 方塊的範圍內，最多只會生成一座海底神殿。